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交芦庵原名正等庵、芦庵，位于秋雪庵之东。据咸淳志记载，宋绍兴年间(公元1131-1156年)侍卫马军司创建。至明万历初年(公元1573)，如觉法师从龙归坞移锡于此。宗伯董其昌题名为“茭芦”据说此题名为“交芦”之误。因为“交芦”是取佛经“根、尘、识三都无实性，同于‘交芦’之义。”亦以庵构建在芦荡之中，故直名“芦庵”自此之后正等庵就改名交芦庵了。
明崇祯改元(公元1628)，如觉法师的后嗣性法师逝世，瑞法师接任住持之职。瑞法师能出色地继承了先师的遗业，拓庵成院。四周以竹篱为围墙，篱门虽设而不关。魏塘大学士钱士升为它题额，名曰：“复古正等院”拓建后的正等院，前面为忏堂三间，大学士张瑞图替忏堂题名为“园应”堂中设如来佛祖释迦牟尼和千手千跟观世音菩萨尊像。圆应堂后面为三间观堂，两侧厢屋“蜂房燕寝”住着很多僧众，又简陋又拥挤。圆应堂前种植多种名花，其中有一种叫千叶杜鹃者十分珍奇名贵。后面天井中种有桃花、茶花，还有藤本打结树。其中有二块太湖石碑，大小形状与宝刹塔的石碑一模一样。大约在清朝咸丰、道光年间，庵中还有副匾额曰：“河渚名蓝”不知谁氏题篆。首任住持如觉，字照空，钱塘人，姓徐，原拜正等庵奎公为师，剃度出家。出家后当行足僧，到处游历，遍访名山大师。他到过的地方有清凉山、峨眉山、洛伽山、鸡足山，以及湖南、广东等处。
其访问的对象，除得道高僧外，还有颇具名望的辅宰大臣，这种游历，增加了他的学识，提高了他的觉悟，归来后，在法华坞遗址上扎一茅庵住下来。十六年中诵法华经5000余部，又历经五年，专修佛教忏法。奎公圆寂后，如觉法师移锡交芦庵，接替奎公为住持。明万历丙辰(公元1616)交六月，很恬静地坐化了。
交芦庵香火很盛，环境清幽。庵中茶烟缭绕，连云带雾，溶浊连绵。四周水波荡漾，光摇碎影。渔鸥戏水，时没时浮，令人忘机得趣。吴本泰有菩萨蛮词曰：
问津未解交芦喻，折芦人在芦中住。我欲叩三缘，来参解脱禅。茶烟接云际，天水俱摇曳。落照其悠悠，前汀双白鸥。
华淑亦有访交芦庵一诗：
三月气始齐，繁荫杂成片。
摇摇舸首烟，柔风拂吾面。
溯洄不一溪，一溪或数转。
水狭仅容舠，登涉适其便。
津津茶桑色，芦青百亩遍。
庵各水中央，绿纹绕如线。
拈花萃庭栏，亘外春山晏。
门篱设不关，啼鸟参幽院。
钟声历晴晖，静立机难荐。
中流月半生，照我舟行倦。
一庵复一庵，清光通天倩。
清陈文述交芦庵诗曰：
我来交芦庵，因识交芦义。
参透根识尘，香光老居士。
缅怀琅*（*：左女右“擐”字的右边旁）翁，留诗证禅味。
交芦庵藏有很多名家笔墨，历代文人颇多记述，如蒋坦秋灯琐忆云：“明日更游交芦、秋雪诸刹，寺僧以松萝茶进，并紫题‘交芦雅集图卷’。俞明震：“老僧解事列藏轴，觅遍题名感陈迹。”陈三立：“老僧列藏轴，风味瀛洲彦。”
庵僧笃好文事，能诗文，重笔墨收藏。逢客殷殷款茶膳，出轴索题，沿习成风，所知盖自智一即然。直到民初，流风不衰，此皆历历可考者也。
据查证：道光十年(公元1830)戴熙访蒹葭里，以“一曲溪流一曲烟”诗意画交芦庵长卷，(210mx26。7cm，现存上海博物馆)。西湖区政协托人联系未果，当不惜费财力，穷予追究。另据村民回忆，藏轴中还有唐伯虎画，可惜这些众多的藏轴，解放后，有的当作柴火烧了，可惜之至！
由于文人墨客时常雅聚在交芦庵相互切磋诗艺，挥毫泼墨，再加游人从秋雪庵、蒹葭里游毕归来，到达交芦庵天色已晚，所以，有很多人欲寄宿在交芦庵，于是，索性将两侧厢房改成书画廊，专作悬挂书画之用。左侧书画廊的墙壁上还镶嵌着四尊铁佛。另外在庵的东侧建造三间楼房作为客舍，客舍后面和东面是一大池塘，塘上搭一座三间门面的水阁楼，这就是厉（厉鹗）、杭（杭世俊）二公祠，左边有木桥通往曲水庵。
民国的石克士先生曾经游过交芦庵，写下交芦庵及归舟一文。内有文曰：“门前芦苇丛丛，不亚秋雪胜境，惟屋宇较低，无登楼一览飞花曳素之概。正门封闭，游客率由侧门入内，寺僧适赴城内未归，香积厨中柴枝狼籍，殿宇亦颓败了无足观。是唐宋时本名正等庵，明董其昌改今名，院内天竹一株，巨杆纷拏，结实累累，红如串珠，僧人净室略见整洁，有清和亲王所书一联：风轻水初绿，日晴花更新。字迹颇颖秀可喜。”未归之僧回来后，怕他坐着无趣“乃导引参谒其新修之厉鄂祠堂，祠宇虽甚朗洁，而中空无有，仅石碑一，为马叙伦撰文，又供有樊榭及其姬人月上栗主。祠后小阁一楹，正对荷塘，夏日芙蕖盛开，风景当亦不弱，惜此际仅芳塘浅沼，水流清漪可供赏鉴耳。僧某絮絮告余，谓‘此祠新修已耗二千余金，庙产太少，非赖大护法培护不能维持。’又云：‘樊榭词人已经绝嗣，衲住持此间不仅在佛门，抑且有关词人血食。’语多委琐可笑，余等以其有写缘簿意，乃相戒于色，结果仅付以茶资兴辞而出。”
石克士写此文的时间距今几十年过去了，交芦庵与西溪的大多数寺宇一样，早已寺毁香灭，原址上仅存两棵老槐树了。原建筑被文革中的“人民公社大会堂”所覆盖，上书“农业学大寨”五个字，昭示着交芦庵的历史结束了。曾经响在交芦庵上空的钟声、僧人念经声以及文人雅士的吟咏之声，亦早已随着西溪的风散逸殆尽了。但愿有一天，我们能够在西溪重新听到交芦庵钟声。我想：这个愿望实现的时间不会太长的。